简述多态性EB病毒编码病毒白介素-10基因多态性

论文导读：
摘要：目的EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)开放读码框架BamHI-C片段(BCRFI)与人白介素-10(hIL-10)基因有高度同源性,其编码的病毒IL-10(vIL-10)与hIL-10有相似的生物学活性,主要体现为免疫抑制活性。本探讨旨在明确鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma, NPC)、EBV相关胃癌(EBV-associated gastric carcinoma, EBVaGC)和健康人群中vIL-10的变异规律,研究其变异作用。办法对164例山东地区EBV阳性标本,包括83例NPC和41例EBVaGC组织从及40例健康成年人咽漱液(Throat washing,TW)标本提取DNA,采取PCR和DNA测序检测vIL-10编码基因BCRFI的序列,运用DNAStar软件对vIL-10基因核苷酸及氨基酸序列进行比较分析。与EBV标准株序列对比,根据vIL-10成熟蛋白和信号肽区域出现的特点性转变对变异进行分类,对比NPC、EBVaGC和健康人群变异型的分布,分析序列变异对蛋白功能的影响。同时与从往发表同一人群EBV基因组BamHIF片段缺乏或出现BamHI识别位点的F/f分型(F和f型EBV)、早期基因BARF1变异(B95-8、V29A和Others变异型)进行连锁分析。结果①运用DNA Star MegApgn分析,NPC、EBVaGC和健康人群TW标本中vIL-10基因序列相似性高达98.8%,126例(76.8%,126/164)标本与标准株B95-8氨基酸序列一致,被分类为B95-8变异型。②vIL-10成熟蛋白序列未发现共有氨基酸突变,出现6处无规律散在突变；vIL-10基因信号肽序列共发现2处共有错义突变(V6M和G23S)和4处散在突变(R4S、L5F、C21R和D25N)。32例(19.5%,32/164)标本在信号肽区域发生氨基酸突变,被分类SPM变异型,另外6例(3.7%,6/164)标本在成熟蛋白序列各出现1处无规律散在突变,分类为其它组(Others)。③vIL-10成熟蛋白序列受体结合区域及免疫抑制功能区域均高度保守,信号肽序列某些变异可能会影响信号序列的切割及蛋白质分泌。④NPC、EBVaGC和健康人群均从B95-8变异型检出率最高,但SPM变异型仅在25例NPC(30.1%,25/83))NPC组织标本和7例(17.5%,7/40)健康人群TW标本中检出,EBVaGC组织中未发现该变异型,vIL-10变异型在NPC和健康人群的分布与EBVaGC显著不同(EBVaGC vs NPC:P0.0001; EBVaGC vs TW:P=0.006), NPC和健康人群之间的分布无明显性差别(P=0.255)。⑤F/f分型、BARF1和vIL-10变异均成功检测的145例标本共发现10种不同的连锁基因型(BamHI F/BARF1/vIL-10),从typeF/B95-8/1395-8最为多见,占67.6%(98/145)。10种连锁基因型在EBVaGC和健康人群之间的分布无明显性差别(P=0.480),但二者与NPC的分布不同,差别有明显性(NPC vs EBVaGC:P0.0001; NPC vs健康人=0.007), type f/V29A/SPM、 type F/V29A/B95-8和type F/B95-8/SPM在NPC具有相对较高的检出率。F型和f型EBV毒株中BARF1/vIL-10基因型的分布不同(P0.0001),f型EBV主要对应V29A/SPM,占78.6%(11/14),而F型EBV主要对应B95-8/B95-8,占74.8%(98/131)。结论①vIL-10基因序列高度保守,尤其是其功能区。高度保守的序列利于其发挥免疫抑制功能,以而帮助EBV逃避和抵抗宿主免疫体系的抗病毒意义,长期在宿主体内寄生。②B95-8变异型是山东地区vIL-10主要型别,SPM变异型可能与鼻咽部和口咽部上皮细胞相关。③BamHI F、BARF1和vIL-10基因变异有着关联性,NPC中f型EBV主要对应V29A/SPM基因型,且type f/V29A/SPM连锁基因型在NPC检出率相对较高,提示其与NPC相关。BamHIF、BARF1和vIL-10基因论文导读：7-9第一章材料与办法9-141.1仪器、试剂和耗材9-101.2探讨对象101.3核酸提取10-121.4vIL-1O编码基因BCRF1序列多态性检测12-131.5统计学分析13-14第二章结果14-222.1vIL-10基因序列保守性142.2vIL-10基因序列变异性14-162.3EBV阳性细胞系vIL-10基因序列162.4vIL-10功能区序列变异16-182.5vIL-10变异类型在三种人群
变异与NPC发生的相关性尚需采集NPC高发区NPC和非NPC标本加从证实。关键词：EB病毒论文vIL-10论文鼻咽癌论文胃癌论文基因多态性论文
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Abstract4-7
引言7-9
第一章 材料与办法9-14

1.1 仪器、试剂和耗材9-10

1.2 探讨对象10

1.3 核酸提取10-12

1.4 vIL-1O编码基因BCRF1序列多态性检测12-13

1.5 统计学分析13-14

第二章 结果14-22

2.1 vIL-10基因序列保守性14

2.2 vIL-10基因序列变异性14-16

2.3 EBV阳性细胞系vIL-10基因序列16

2.4 vIL-10功能区序列变异16-18

2.5 vIL-10变异类型在三种人群中的分布18-19

2.6 vIL-10、BARF1和BamHI F基因变异连锁分析19-22

第三章 讨论22-26
探讨结论26-27
参考文献27-33
综述33-46
参考文献41-46
攻读学位期间的学术成果46-47
致谢47-48