试谈基因芯片重楼属基因多样性与基因芯片鉴别基本

论文导读：功能基因最丰富,进而富含大量的次生代谢产物如黄酮、生物碱、萜类等。最后将植物群落基因组芯片鉴别了凌云重楼和壶瓶山重楼,结果表明凌云重楼比壶瓶山重楼功能基因丰富,有效成分含量更高,更具有药用价值。关键词：重楼属论文rbcL论文atpB和18SrDNA论文基因芯片论文药用植物论文本论文由{#GetFullD
摘要：药用植物基因多样性即遗传多样性,是指蕴藏在植物个体基因里的所有遗传信息的总和,包括一个群体内不同个体或种内不同群体之间的遗传变异。全面准确地了解药用植物基因多样性,将能探明其进化的历史,有助于资源开发、物种保护及种资源保护。传统中药多是复方制剂,成分多样且作用机制复杂,这给药物探讨带来很大的困难。而基因芯片技术具有大规模、高通量、平行检测等优势,是以基因层面来鉴别植物,不会受植物不同取样部位、不同取样时间以及不同前处理历程与方式的影响,结果稳定,重复性好。重楼属植物是极具药用价值的植物,但长期以来其野生资源被过度采集,在许多地区已濒临灭绝,由此开展其物种分子水平的探讨很有必要。本探讨测定了壶瓶山8种重楼属样品rbcL基因、atpB基因和18SrDNA基因序列,比较了该3个基因的差别,构建了基于这3个基因序列的遗传进化树,浅析它们的同源性联系,对其属下分类及亲缘联系进行了描述,探讨重楼属植物的基因多样性。利用现有药用植物基因资源筛选其特异性片段制作探针。然后用接触式点样法构建用于药用植物浅析的基因芯片,优化了芯片杂交的关键技术,探讨最优杂交温度为55℃。用基因芯片检测了10种药用植物：长春花、银杏、青蒿、文县黄耆、杜仲、黄连、野薄荷、红豆杉、华中雪莲、黄芩。长春花的功能基因最丰富,进而富含大量的次生代谢产物如黄酮、生物碱、萜类等。最后将植物群落基因组芯片鉴别了凌云重楼和壶瓶山重楼,结果表明凌云重楼比壶瓶山重楼功能基因丰富,有效成分含量更高,更具有药用价值。关键词：重楼属论文rbcL论文atpB和18SrDNA论文基因芯片论文药用植物论文
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ABSTRACT5-9
第一章 绪论9-21

1.1 药用植物基因多样性探讨9-15

1.1 探讨药用植物基因多样性的作用9-10

1.2 探讨药用植物基因多样性的进展10-11

1.3 重楼的分子系统分类和基因多样性探讨进展11-15

1.2 基因芯片技术的运用15-18

1.2.1 基因芯片技术的介绍15-16

1.2.2 基因芯片技术的运用16-17

1.2.3 基因芯片技术在中医药探讨的运用17-18

1.论文导读：论24-332.4.1浅析DNA浓度与纯度24-252.4.2rbcL、atpB和18SrDNA的PCR扩增条件25-272.4.3rbcL、atpB、18SrDNA的序列浅析及结果27-332.5小结33-35第三章基因芯片鉴别药用植物35-443.1引言353.2实验材料35-363.2.1主要试剂和仪器353.2.2样品来源35-363.3实验策略36-383.3.1提取与纯化植物总DNA36-373.3.2设计探针和
3 本论文的探讨目的、内容及作用18-19

1.3.1 本论文的探讨目的和作用18-19

1.3.2 本论文的探讨内容19

1.3.3 本论文课题资助情况19

1.4 小结19-21

第二章 重楼属植物的基因多样性21-35

2.1 引言21

2.2 实验材料21-22

2.1 主要试剂和仪器21-22

2.2 样品来源22

2.3 实验策略22-24

2.3.1 DNA的提取22-23

2.3.2 测定DNA纯度与浓度23

2.3.3 rbcL、atpB、和18SrDNA的PCR扩增与测序23-24

2.4 结果与讨论24-33

2.4.1 浅析DNA浓度与纯度24-25

2.4.2 rbcL、atpB和18SrDNA的PCR扩增条件25-27

2.4.3 rbcL、atpB、18SrDNA的序列浅析及结果27-33

2.5 小结33-35

第三章 基因芯片鉴别药用植物35-44

3.1 引言35

3.2 实验材料35-36

3.

2.1 主要试剂和仪器35

3.

2.2 样品来源35-36

3.3 实验策略36-38

3.1 提取与纯化植物总DNA36-37

3.2 设计探针和构建芯片37

3.3 DNA的荧光标记37-38

3.4 芯片杂交38

3.5 图像处理和数据浅析38

3.4 结果与讨论38-43

3.4.1 探针设计38-40

3.4.2 评估基因芯片的特异性40

3.4.3 10种药用植物的芯片检测40-43

3.5 小结43-44

第四章 基于生物信息学和基因芯片的重楼基因差别浅析44-54

4.1 引言44

4.2 基于Restriction Difference壶瓶山重楼与凌云重楼的差别浅析44-49

4.3 基于Structure的壶瓶山重楼与凌云重楼的差别浅析49-51

4.4 基于基因芯片的凌云重楼和壶瓶山重楼差别性浅析51-52

4.5 小结52-54

第五章 结论54-55
参考文献55-60
致谢60-61
攻读学位期间主要探讨成果61